膽道癌的臨床、基因組和轉錄組數據分析揭示了亞型特異性免疫特徵

方法 從三種膽道癌亞型（肝內膽管癌、肝外膽管癌和膽囊癌）的Tempus 數據庫中，我們分析未識別的臨床、基因組和轉錄組數據得出突變頻率和突變分群，我們隨之確定特定分子改變與解剖亞群和膽道癌免疫微環境特徵之間的關係。

結果 我們分析了 454 個膽道癌樣本，其中最常檢測到的變化是 TP53 (42.5%)、CDKN2A (23.4%)、ARID1A (19.6%)、BAP1 (15.5%)、KRAS (15%)、CDKN2B (14.2%) 、PBRM1 (11.7%)、IDH1 (11.7%)、TERT (8.4%)、KMT2C (10.4%) 和 LRP1B (8.4%) 和 FGFR2 融合 (8.7%)。30.5%的膽道癌發現了潛在的可操作分子改變，其中的39.1%來自IHC檢測。整合式分析顯現了四個不同的分子分群，其中分群四主要與 IHC 中的 FGFR2 重排和 BAP1 突變相關。分群一指出發炎性腫瘤免疫微環境的免疫相關生物標誌物升高，其中多為 TP53、KRAS 和 ATM 突變。其他常見相關基因，包括TP53、FGFR2、IDH1、TERT、BRAF和BAP1均個別地跟膽道癌免疫微環境相關。

結論 膽道癌亞型表現出不同的 DNA 改變、RNA 炎性符號和免疫生物標誌物。特定膽道癌亞型、分子改變和免疫表型之間的關聯，凸顯了開發療法的新機會。

查看文獻全文