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JCO Precision Oncology, Authors
Lorenzo Gerratana, Michael Movarek, Firas Wehbe, Neelima Katam, Devalingam Mahalingam, Jeannine Donahue, Ami Shah, Young K. Chae, Mary Mulcahy, Dean Tsarwhas, Victoria Villaflor, Aparna Kalyan, Maha Hussein, Jyoti Patel, Sunandana Chandra, Leonidas C. Platanias, William Gradishar, Massimo Cristofanilli, and Amir Behdad
2022年6月29日
本篇的研究目的是評估循環腫瘤DNA在多種腫瘤類型中的應用性。循環腫瘤 DNA (ctDNA) 已成為一種被認可的非侵入性取得的生物標誌物，被用於在整個疾病管理過程中對腫瘤進行基準線的描述和進程監測。
方法 我們回顧性研究 1,763 名晚期癌症患者，他們通過西北大學指定的商業檢測完成了ctDNA 或腫瘤組織的次世代定序。
結果 ctDNA 在 90% 的患者中發現了至少一種基因改變。「檢測到改變數 (NDA)」 和「突變等位基因頻率 (MAF)」 的數量因腫瘤類型而異，在胃癌、結腸直腸癌和乳腺癌中觀察到的 MAF 最高，在結腸直腸癌、肺鱗狀細胞癌中觀察到的 NDA 最高和卵巢/子宮內膜癌。 TP53是所有腫瘤類型中突變最多的基因。 PIK3CA、ERBB2、BRCA1 和 FGFR1 改變與乳腺癌相關且發現 ESR1 突變僅在這種腫瘤類型中檢測到。結直腸癌的特徵是 KRAS 和 APC 突變的改變，而 KRAS、EGFR、PIK3CA 和 BRAF 突變在肺腺癌中很常見。
在血液和組織定序觀察到，主幹基因突變（例如，APC 和 KRAS）具有一致性顯著，但是與抗藥相關的基因（例如，RB1 和 NF1）中經常觀察到低一致性。不同腫瘤類型的腫瘤突變負荷 (TMB) 差異顯著，具有高 MAF 或 NDA 的患者在其中一種研究平台上的 TMB 評分顯著更高。
結論 本研究為跨實體瘤的ctDNA突變觀察提供了更大視角的見解，為將來組織學類型不可知時結合組織生物標誌物如TMB的工作流程，提出了新的假設生成數據和警告。