現實世界中非小細胞肺癌患者分群中的BRAF基因突變和融合情況

背景 BRAF V600E（一類）基因突變的非小細胞肺癌的特徵很明確。然而，對這一人群中其他類別的BRAF基因突變或BRAF融合的了解較少。以前的研究顯示，不同類別的BRAF突變可能有不同的臨床意義，我們進一步研究臨床實踐中的治療指導方案。在這項工作中，我們利用綜合基因組分析對現實世界非小細胞肺癌分群中的BRAF基因和BRAF基因融合的進行了特徵探討。

方法 我們回顧性地分析了去識別記錄的6,511名接受Tempus xT檢測的非小細胞肺癌患者（對648個基因進行500倍覆蓋的DNA-seq，並對一部分患者進行全轉錄組RNA-seq）。 BRAF突變根據發表的文獻進行分類（PMID：33019809）。

結果 我們發現322/6,511（4.9%）名患者有致病性BRAF變異。 322名BRAF突變患者的群體包括87名一類患者（27.0%）、82名二類患者（25.5%）、83名三類患者（25.8%）和70名其他/未分類（21.7%）。基因組分析確定了不同BRAF級別的聯合突變情況的幾個顯著差異，包括EGFR、KRAS和NF1（q<0.05）。致病性EGFR突變在一類（20%）與二類（6.1%）和三類（7.2%）中更為普遍。相比之下，KRAS突變在二類（13%）和三類（19%）比一類（3.4%）更普遍。同樣，NF1突變在二類（9.8%）和三類（12%）與一類（2.3%）中更普遍。值得注意的是，DNA和RNA基因融合分析確定了13名患者有致病性BRAF融合；其中11/13名僅作過RNA-seq。

結論 DNA和RNA-seq分析顯示，與一類相比，BRAF 二類和三類突變與不同的基因組特徵有關，如更頻繁地同時發生RAS和NF1基因突變。還發現了BRAF基因融合，主要是透過RNA定序被檢測出。

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